Les baha\u00efs install\u00e9s en \u00c9gypte depuis le 19e si\u00e8cle voient leur existence menac\u00e9e en raison de discriminations encourag\u00e9es par l\u2019\u00c9tat. Celui-ci refuse de reconna\u00eetre leur personnalit\u00e9 juridique. Ainsi, comme les mariages ne sont pas reconnus, les enfants grandissent sans statut juridique ; on ne leur accorde d\u00e8s lors ni nationalit\u00e9 ni droit de s\u00e9jour, et ils n\u2019ont pas droit \u00e0 une formation ni \u00e0 une s\u00e9pulture digne de ce nom. Selon le rapporteur sp\u00e9cial des Nations Unies, leurs droits sont bafou\u00e9s tant de leur vivant qu\u2019apr\u00e8s leur mort. Les mesures de surveillance syst\u00e9matique et les interrogatoires sont contraires \u00e0 la libert\u00e9 religieuse, \u00e0 la libert\u00e9 de rassemblement et \u00e0 la libert\u00e9 d\u2019association.
La communaut\u00e9 ahmadie fait elle aussi l\u2019objet de pers\u00e9cutions : nombre de ses membres sont victimes d\u2019actes de violence, de mesures de d\u00e9tention arbitraire et de disparitions forc\u00e9es. La communaut\u00e9 chr\u00e9tienne copte est confront\u00e9e quant \u00e0 elle \u00e0 des actes de violence commis pour des motifs religieux, \u00e0 des discriminations dans le domaine de la formation, \u00e0 des restrictions concernant le port de symboles religieux et \u00e0 du harc\u00e8lement fond\u00e9 sur le sexe.